Logros de la biotecnología computacional

Cytoscape

Es una plataforma de software que permite la visualización de la interacción de redes moleculares y caminos biológicos y, también, permite la integración de esas redes con anotaciones, perfiles de expresiones de genes y otro tipo de datos. A pesar que Cytoscape fue originalmente diseñador por investigadores biológicos, ahora es una plataforma general para el análisis de redes complejas y su visualización. Para más información haced click en el siguiente enlace

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SMuFinP

(Somatic MUtation FINder) permite, por primera vez, detectar de forma rápida, precisa y sencilla los cambios genómicos responsables de la aparición y progresión de los tumores. La gran ventaja de este atajo para adelantarse a la enfermedad es, según los investigadores, que debido a su gran potencial de rastreo permite dar en pocas horas (frente a los días e incluso semanas que requerían los métodos convencionales) con cambios genéticos que antes quedaban ocultos. Desarrollado por el grupo de genómica computacional del Barcelona Supercomputing Centro- Centro Nacional de Supercomputación (BSC-CNS). Para más información haced click en el siguiente enlace

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gCOMBINE

Es una superficie grafica (GUI) que permite al usuario llevar a cabo una comparación de la energía de enlace combinando el análisis de un conjunto de ligando-receptor con la ayuda de la derivación de potentes estructuras informáticas cuantitativas. Para más información haced click en el siguiente enlace

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CRDOCK

Es una herramienta flexible para llevar a cabo ‘docking’ y ‘virtual screening’. El principal objetivo del programa es la velocidad para ser aplicada a ‘virtualscreening’. Para más información haced click en el siguiente enlace

ProteinEvolver

Genera códigos de muestras de genes y secuencias proteicas desarrollados a lo largo de filogenias bajo modelos de sustitución de las estructuras básicas. Estos modelos consideran la estructura proteica para evaluar la posibilidad de mutación, las cuales pueden ser aceptadas o rechazadas dependiendo de la energía de la estructura proteica de la secuencia mutada. Para más información haced click en el siguiente enlace

"Blue gene"

Es el ordenador más potente del mundo en la lista de supercomputadores publicada en noviembre de 2005. Está instalado en el laboratorio estadounidense Lawrence Livermore. Gracias a esta computadora, EE. UU. volvió a encabezar la lista de las máquinas más potentes del mundo, arrebatándole el título a Japón. Esta superordenador de IBM consiguió resolver las ecuaciones del test de Linpack a una velocidad de 36,01 teraflops (36,01 billones de operaciones en punto flotante por segundo) y se dedicó al cálculo de la estructura atómica tridimensional de proteínas. Superó por poco a la máquina japonesa que la ostentaba en 35,86 teraflops. El Blue Gene/L ocupa 320 metros cuadrados, esto es 100 veces menos que la nipona. Consume tan solo 216 kilovatios, frente a los 6000 que gasta su rival. Para más información haced click en el siguiente enlace

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